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| 姓名 | 名称 | 职务 | 任职时间 | 
| 刘思职 | 国立北京大学医学院药学系 | 系主任 | 1943-1945 | 
| 陈同度 | 国立北京大学医学院药学系 | 系主任 | 1945-1947 | 
| 薛愚 | 国立北京大学医学院药学系 | 系主任 | 1947-1958 | 
| 王序 | 北京医学院药学系 | 系主任 | 1958-1966 | 
| 王序 | 北京医学院药学系 | 系主任 | 1978-1983 | 
| 王夔 | 北京医学院药学系 | 系主任 | 1983-1985 | 
| 王夔 | 北京医科大学药学院 | 院长 | 1985-1988 | 
| 张礼和 | 北京医科大学药学院 | 院长 | 1988-1999 | 
| 彭师奇 | 北京医科大学药学院 | 院长 | 1999-2004 | 
| 刘俊义 | 北京大学药学院 | 常务副院长 | 2004-2005 | 
| 刘俊义 | 北京大学药学院 | 院长 | 2005-2016 | 
| 周德敏 | 北京大学药学院 | 院长 | 2016-2023 | 
| 叶敏 | 北京大学药学院 | 院长 | 2023年至今 | 
1953年至今历任党组织负责人名单
| 姓名 | 名称 | 职务 | 任职时间 | 
| 嵇静德 | 北京医学院药学系 | 总支书记 | 1953.07-1964.08 | 
| 韩娟 | 北京医学院药学系 | 总支书记 | 1964.09-1966.06 | 
| 闫景波 | 北京医学院药学系 | 总支书记 | 1971.06-1973.12 | 
| 嵇程 | 北京医学院药学系 | 党委书记 | 1973.12-1978.08 | 
| 韩娟 | 北京医学院药学系 | 党委书记 | 1978.08-1983.10 | 
| 高秀云 | 北京医科大学药学院 | 党委书记 | 1983.10-1994.04 | 
| 洪和根 | 北京医科大学药学院 | 党委书记 | 1994.04-2005.02 | 
| 解冬雪 | 北京大学药学院 | 党委书记 | 2005.02-2010.07 | 
| 徐萍 | 北京大学药学院 | 党委书记 | 2010.07-2022.10 | 
| 焦宁 | 北京大学药学院 | 党委书记 | 2022.10至今 |