1. 王夔院士获“何梁何利基金”科学与技术进步奖。
2. 张礼和院士在旧金山召开的国际药学联盟FIP千禧年世界药学会上荣获国际药学会千禧年奖，张礼和院士是中国唯一的获奖者。
3. 我院进行学科重组，建立了六个系、一个实验教学中心，使我院的学科建设更具合理性和科学性。
4. 我院“211工程”建设项目子项目“现代药学和新药研究”于10月24日顺利通过验收，获得综合评估91.4分。
5. 张礼和院士主持研制的一类抗肿瘤新药8氯腺苷即将进入Ⅲ期临床研究。
6. 我院2000年在国外发表论文31篇，被SCI收录的论文41篇（其中国外27篇，国内14篇）。
7. 叶新山博士被聘为我院药物化学专业特聘教授。
8. 我院国家新药筛选实验室通过国家科委验收，成为全国五个国家药物筛选实验室之一。
9. 我院实验教学中心完成一期建设并正式投入使用；进一步调整完善了大药学一级学科课程设置，新的课程体系有利于培养高素质药学人才。
10. 我院荣获北京市教育成果一等奖。
